文件夹保护功能对文件夹的大小有没有限制？

没有限制。

超级加密3000的【文件夹保护】模块下，加密码和隐藏主要针对于一些不是十分重要但比较大的文件夹，其特点是保护、解除保护速度特别快，并且不额外占用磁盘空间。

文件夹保护后防删除、复制和移动。

所以文件夹加密码和文件夹隐藏特别适合那些存放有影视资料的文件夹，这些文件夹一般都非常大。如果您用常规的保护方法，保护和解除保护的过程是十分缓慢的。